A Shippuden, a Naruto című anime folytatása.

2 és fél évvel késöbb játszódik.
Naruto újra visszatér Konohába, immáron erősebb, érettebb és technikásabb ninjaként. Bár ő még mindig genin (Mivel ezalatt a 2 és fél év alatt nem volt Konohában és nem tette le a vizsgát), Jiraiya tanítása nagymértékben látszik rajta.
Bár még mindig szokott bohóckodni, lényegében megkomolyodott.

A Naruto shippuuden (ナルト 疾風伝, nyugaton Naruto Shippūden)a Naruto első sorozatának folytatása, mely az eredeti manga Második részének cselekményeit tartalmazza, mely a 28. kötettel vette kezdetét. A Naruto shippuuden első epizódját 2007. február 15-én sugározta Japánban a TV Tokyo. A sorozatot a Studio Pierrot készíti Date Hajato rendezésével.Az első Japánon kívüli tévécsatorna a fülöp-szigeteki ABS-CBN, 2008. január 28-án műsorára tűzte a sorozatot, és 2008. március 19-ig az első 40 részt sugározta. 2009. január 8-tól a TV Tokyo az interneten is megkezdte az újabb részek sugárzását a feliratkozó felhasználók számára. Az egyes epizódok a japán premiert követően egy órán belül angol felirattal megtekinthetőek.A Viz Media 2009. január 15-től szintén elkezdte a sorozat japán nyelvű, angol feliratos változatának internetes sugárzását saját hivatalos honlapján keresztül. A feltöltött epizódok között megtalálhatóak a korábbi és az újabb részek is. 2009. október 28-ától, az angol szinkronos Naruto shippuudent a Disney XD heti egy epizóddal sugározza.

A sorozat 2. régiókódú DVD-n Japánban egy lemezen négy, vagy öt epizóddal jelenik meg. Négy DVD évadot adtak ki az eddig részek felosztása alapján. A hetedik Naruto shippuuden DVD-hez tartozik egy spciális rész, mely a második végefőcím alapján készült. A megszokott DVD-k mellett 2009. december 16-án kiadják a 119-120. epizódot, a Kakashi gaiden: Egy fiú élete a harcmezőn (カカシ外伝～戦場のボーイズライフ～, Kakashi gaiden)című speciált - mely Hatake Kakashi gyermekkorában játszódik - egy DVD-n.Észak-Amerikában a sorozat első DVD-je 2009. szeptember 29-én jelent meg.